Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXQ1Q9C009 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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