Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf50Q9BV19 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf50Q9BV19 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms