Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM208Q9BTX3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM208Q9BTX3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM208Q9BTX3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM208Q9BTX3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM208Q9BTX3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM208Q9BTX3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM208Q9BTX3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM208Q9BTX3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM208Q9BTX3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM208Q9BTX3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM208Q9BTX3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms