Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ0

PYGO2, Pygopus homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO2Q9BRQ0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PYGO2Q9BRQ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGO2Q9BRQ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PYGO2Q9BRQ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PYGO2Q9BRQ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PYGO2Q9BRQ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PYGO2Q9BRQ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PYGO2Q9BRQ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PYGO2Q9BRQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PYGO2Q9BRQ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PYGO2Q9BRQ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PYGO2Q9BRQ0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PYGO2Q9BRQ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PYGO2Q9BRQ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PYGO2Q9BRQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms