Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF8Q9BRL6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF8Q9BRL6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF8Q9BRL6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF8Q9BRL6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF8Q9BRL6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF8Q9BRL6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF8Q9BRL6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF8Q9BRL6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF8Q9BRL6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF8Q9BRL6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF8Q9BRL6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF8Q9BRL6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF8Q9BRL6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF8Q9BRL6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF8Q9BRL6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF8Q9BRL6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms