Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK5RAP2Q96SN8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK5RAP2Q96SN8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms