Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT74Q96LB3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT74Q96LB3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT74Q96LB3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT74Q96LB3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT74Q96LB3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT74Q96LB3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT74Q96LB3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT74Q96LB3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT74Q96LB3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT74Q96LB3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT74Q96LB3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT74Q96LB3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT74Q96LB3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT74Q96LB3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT74Q96LB3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT74Q96LB3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT74Q96LB3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT74Q96LB3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT74Q96LB3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT74Q96LB3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT74Q96LB3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT74Q96LB3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT74Q96LB3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT74Q96LB3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT74Q96LB3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms