Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNX27Q96L92 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX27Q96L92 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1661.1 ms