Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP47Q96K76 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
USP47Q96K76 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms