Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDHR1Q96JP9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDHR1Q96JP9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDHR1Q96JP9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDHR1Q96JP9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDHR1Q96JP9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDHR1Q96JP9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDHR1Q96JP9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDHR1Q96JP9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDHR1Q96JP9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDHR1Q96JP9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDHR1Q96JP9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDHR1Q96JP9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms