Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ATG4CQ96DT6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG4CQ96DT6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms