Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFHD2Q96C19 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFHD2Q96C19 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFHD2Q96C19 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFHD2Q96C19 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFHD2Q96C19 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHD2Q96C19 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHD2Q96C19 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHD2Q96C19 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHD2Q96C19 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFHD2Q96C19 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD2Q96C19 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms