Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMIGD2Q96BF3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms