Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VOPP1Q96AW1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VOPP1Q96AW1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms