Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74AQ96AQ1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74AQ96AQ1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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