Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCE1Q969G3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms