Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCEAL3Q969E4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCEAL3Q969E4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms