Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC4Q92889 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms