Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTRA1Q92743 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTRA1Q92743 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HTRA1Q92743 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA1Q92743 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms