Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSPC1Q8WXF1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSPC1Q8WXF1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
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