Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW59

SPRYD4, SPRY domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD4Q8WW59 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SPRYD4Q8WW59 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPRYD4Q8WW59 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRYD4Q8WW59 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRYD4Q8WW59 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRYD4Q8WW59 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRYD4Q8WW59 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRYD4Q8WW59 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRYD4Q8WW59 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRYD4Q8WW59 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRYD4Q8WW59 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRYD4Q8WW59 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRYD4Q8WW59 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRYD4Q8WW59 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRYD4Q8WW59 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRYD4Q8WW59 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRYD4Q8WW59 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms