Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM71BQ8TC56 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM71BQ8TC56 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms