Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HELBQ8NG08 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HELBQ8NG08 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms