Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP9

NBEA, Neurobeachin, humanhuman

Predictions only

Length 2,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAQ8NFP9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NBEAQ8NFP9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBEAQ8NFP9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms