Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFF2

SLC24A4, Sodium/potassium/calcium exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A4Q8NFF2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC24A4Q8NFF2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC24A4Q8NFF2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC24A4Q8NFF2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC24A4Q8NFF2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC24A4Q8NFF2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC24A4Q8NFF2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms