Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF169Q8NCN4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF169Q8NCN4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF169Q8NCN4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
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