Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD1Q8NB12 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD1Q8NB12 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms