Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00528Q8N1L1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms