Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYCE1Q8N0S2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms