Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZQ8

MYOCD, Myocardin, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOCDQ8IZQ8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYOCDQ8IZQ8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYOCDQ8IZQ8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYOCDQ8IZQ8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms