Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RHOT1Q8IXI2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms