Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DZIP3Q86Y13 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DZIP3Q86Y13 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DZIP3Q86Y13 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DZIP3Q86Y13 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DZIP3Q86Y13 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DZIP3Q86Y13 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
DZIP3Q86Y13 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
DZIP3Q86Y13 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DZIP3Q86Y13 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DZIP3Q86Y13 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms