Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VSIG1Q86XK7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VSIG1Q86XK7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms