Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TXNDC2Q86VQ3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TXNDC2Q86VQ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TXNDC2Q86VQ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TXNDC2Q86VQ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms