Protein–RNA interactions for Protein: Q86U06

RBM23, Probable RNA-binding protein 23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM23Q86U06 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM23Q86U06 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM23Q86U06 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM23Q86U06 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM23Q86U06 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM23Q86U06 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM23Q86U06 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM23Q86U06 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM23Q86U06 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM23Q86U06 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM23Q86U06 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM23Q86U06 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM23Q86U06 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM23Q86U06 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms