Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6K3

PTAR1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAR1Q7Z6K3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTAR1Q7Z6K3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTAR1Q7Z6K3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTAR1Q7Z6K3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms