Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP2Q7RTS6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
OTOP2Q7RTS6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTOP2Q7RTS6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms