Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C15orf39Q6ZRI6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C15orf39Q6ZRI6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
C15orf39Q6ZRI6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C15orf39Q6ZRI6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
C15orf39Q6ZRI6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C15orf39Q6ZRI6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C15orf39Q6ZRI6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C15orf39Q6ZRI6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C15orf39Q6ZRI6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C15orf39Q6ZRI6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C15orf39Q6ZRI6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C15orf39Q6ZRI6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C15orf39Q6ZRI6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C15orf39Q6ZRI6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C15orf39Q6ZRI6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C15orf39Q6ZRI6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms