Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCIMPQ6UWF3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCIMPQ6UWF3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms