Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C19orf48Q6RUI8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C19orf48Q6RUI8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms