Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
TNS3Q68CZ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
TNS3Q68CZ2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNS3Q68CZ2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNS3Q68CZ2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms