Protein–RNA interactions for Protein: Q5W188

CST9LP1, Putative cystatin-9-like protein CST9LP1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST9LP1Q5W188 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CST9LP1Q5W188 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CST9LP1Q5W188 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CST9LP1Q5W188 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CST9LP1Q5W188 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST9LP1Q5W188 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms