Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND4CQ5VZ89 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND4CQ5VZ89 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND4CQ5VZ89 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms