Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GARNL3Q5VVW2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARNL3Q5VVW2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms