Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4J0

GCNT6, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 6, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT6Q5T4J0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCNT6Q5T4J0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.1 ms