Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPANXN3Q5MJ09 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPANXN3Q5MJ09 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms