Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C3orf38Q5JPI3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf38Q5JPI3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms