Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDK2Q58EX2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SDK2Q58EX2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms