Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL3Q4VX76 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYTL3Q4VX76 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYTL3Q4VX76 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms