Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GNPTABQ3T906 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GNPTABQ3T906 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPTABQ3T906 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPTABQ3T906 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPTABQ3T906 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPTABQ3T906 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPTABQ3T906 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms